Если вы используете древовидные комментарии, то по умолчанию получаете еще одну внутреннюю ссылку на сайте, вида:
page.html?replytocom=123#respond
а в индексе, еще одну (или в зависимости от количества комментариев к статье) страницу.
В итоге получается очень большое дублирование материалов сайта, что в свою очередь может привести к очень нехорошим последствиям, от пессимизации до фильтра ПС.
Вопрос дублирования контента можно решить с помощью файла robots.txt, который кстати по умолчанию отсутствует в WordPress.